第六届卫生部食品卫生标准专业委员会第二次会议于2009年1月6日在北京召开，来自卫生部、农业部、国家质检总局、商务部、国家食品药品监管局、国家工商总局、中国发酵工业协会、中国肉类协会、中国饮料工业协会、中国乳制品工业协会、中国消费者协会、中国焙烤食品糖制品工业协会、中国塑料加工工业协会、中国酿酒工业协会、国际化学品制造商协会等单位委员在内的33名委员以及通讯成员共60余人参加了会议。
此次会议共审查35项标准，其中包装材料分委会送审20项，食品产品与卫生规范分委会送审8项，微生物分委会送审7项。
通过审查，同意报批的有：《胶原蛋白肠衣卫生标准》、《食品易拉罐内壁水基改性环氧树脂涂料卫生标准》、《食品容器、包装材料用三聚氰胺-甲醛成型品卫生标准》等20项包装材料类标准；《酱油企业良好生产规范》、《食醋企业良好生产规范》2项卫生规范类标准；《果蔬罐头卫生标准》、《淀粉糖卫生标准》、《食醋卫生标准》等3项食品产品类标准；《食品卫生微生物学检验产气荚膜梭菌检验》、《食品卫生微生物学检验创伤弧菌检验》2项微生物方法学标准。《食品中蛔虫卵检验》等5项标准建议征求卫生部寄生虫病标准专业委员会意见。未通过审查的有《小麦粉卫生标准》及《鲜蛋卫生标准》。
会议还对2009年卫生标准制修订项目计划进行了讨论，确定上报59项，其中自筹项目7项。