乳品质量安全标准工作专家组第二次会议于2009年2月16日-17日在北京召开。会议由专家组组长王竹天主持，卫生部食品安全协调与卫生监督局标准处张玲萍处长到会。卫生部、农业部、工业和信息化部、国家质检总局、国家工商总局、国家食品药品监管局、国家标准委、轻工联合会以及大专院校、乳品企业的70余名专家和代表参加了会议。
会议首先通报了专家组第一次会议以来开展的主要工作。包括：相关部门及行业收集了乳品国家和行业标准目录及文本，秘书处进行了汇总；乳品企业对乳品标准使用过程中存在或者可能发生的问题进行了调查，开展了国内外婴幼儿配方食品、乳品产品标准的比较研究，提出了建设性的意见和建议。
此后，乳品产品、婴幼儿配方食品、理化检验方法、微生物检验方法、乳品生产规范5个工作组分别对本组涉及的现行及正在制修订的乳品标准进行了逐项梳理，提出了继续有效、修订、整合修订、新制定等处理意见，并提交专家组进行了集中审议。会议还对乳品质量安全标准框架进行了讨论。
本次乳品质量安全标准工作共涉及标准160余项，经研究讨论，初步确定形成90余项乳品质量安全标准。秘书处将根据各工作组的工作内容和工作量，安排集中时间、地点开展乳品质量安全标准的制修订工作，以保证该项工作按时完成。